Il museo possiede una sezione naturalistica suddivisa in scienze della terra e scienze della vita e una sezione archeologica divisa in preistoria-protostoria ed epoca romana. All'interno della sezione romana è ospitata una pregevole serie di vetri antichi. Molti dei reperti archeologici notevoli vengono dallo scavo della vicina necropoli di Posmon. I servizi che il Museo offre sono diversi: restauro, conservazione dei beni naturalistici e archeologici, esposizione, sale per mostre, servizi didattici, consulenza in ambito storico-archeologico,centro di documentazione, inventariazione e catalogazione informatizzata dei beni archeologici, ricerca scientifica, attività di stampa e altro ancora.